Contents
Index
bamstats-0.2: A program to extract various information from BAM alignmnet files.
Index
add_innie
Bio.SamTools.Classify
add_leftie
Bio.SamTools.Classify
add_outie
Bio.SamTools.Classify
add_rightie
Bio.SamTools.Classify
Bams
Bio.SamTools.Classify
bams
Bio.SamTools.Classify
buckets
Bio.SamTools.Classify
bump
Bio.SamTools.Classify
ccount
Bio.SamTools.Classify
Class
Bio.SamTools.Classify
class1
Bio.SamTools.Classify
classify
Bio.SamTools.Classify
ClassStats
Bio.SamTools.Classify
Collect
Bio.SamTools.Classify
CS
Bio.SamTools.Classify
disp1
Bio.SamTools.Classify
dispheader
Bio.SamTools.Classify
display
Bio.SamTools.Classify
firstUpstream
Bio.SamTools.Classify
H
Bio.SamTools.Classify
hcount
Bio.SamTools.Classify
Hist
Bio.SamTools.Classify
innies
Bio.SamTools.Classify
insert
Bio.SamTools.Classify
Insertable
Bio.SamTools.Classify
isBefore
Bio.SamTools.Classify
isOpposite
Bio.SamTools.Classify
isUnmapped
Bio.SamTools.Classify
kurt
Bio.SamTools.Classify
lefties
Bio.SamTools.Classify
mean
Bio.SamTools.Classify
mkstats
Bio.SamTools.Classify
ncount
Bio.SamTools.Classify
outies
Bio.SamTools.Classify
righties
Bio.SamTools.Classify
S
Bio.SamTools.Classify
showQuants
Bio.SamTools.Classify
skew
Bio.SamTools.Classify
Statistics
Bio.SamTools.Classify
statistics
Bio.SamTools.Classify
Stats
Bio.SamTools.Classify
stdev
Bio.SamTools.Classify
total
Bio.SamTools.Classify
x2sum
Bio.SamTools.Classify
x3sum
Bio.SamTools.Classify
x4sum
Bio.SamTools.Classify
xsum
Bio.SamTools.Classify