Index
| AA | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| aaToHydrophobicity | Data.Fasta.Category |
| attoCLIPFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| attoFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| chunksOf | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| Clone | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| CloneMap | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| Codon | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| codon2aa | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| compl | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Utility, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Utility, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Utility, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Utility, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Utility, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| complRules | Data.Fasta.Utility |
| customCodon2aa | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| customTranslate | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| fastaHeader | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| fastaSeq | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| FastaSequence | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Data Constructor) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Data Constructor) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 6 (Data Constructor) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 7 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 8 (Data Constructor) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 9 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 10 (Data Constructor) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| Germline | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| getField | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Utility, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Utility, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Utility, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Utility, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Utility, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| Hydrophilic | Data.Fasta.Category |
| Hydrophobic | Data.Fasta.Category |
| Hydrophobicity | Data.Fasta.Category |
| Neutral | Data.Fasta.Category |
| parsecCLIPFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| parsecFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| parseCLIPFasta | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| parseFasta | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| pipesCLIPFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| pipesFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| removeCLIPNs | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| removeN | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| removeNs | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| revCompl | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Utility, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Utility, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Utility, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Utility, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Utility, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| ShowFasta | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| showFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| translate | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text |
| 2 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 3 (Function) | Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String |
| 4 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |