fasta-0.9.0.0: A simple, mindless parser for fasta files.

Index

attoCLIPFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
attoFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
chunksOf 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString
Clone 
1 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Type/Class)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
CloneMap 
1 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Type/Class)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
Codon 
1 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Type/Class)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
codon2aa 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String
fastaHeader 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
fastaSeq 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
FastaSequence 
1 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Data Constructor)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
3 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
4 (Data Constructor)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
5 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
6 (Data Constructor)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
7 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
8 (Data Constructor)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
9 (Type/Class)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
10 (Data Constructor)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
Germline 
1 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Type/Class)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
parsecCLIPFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
parsecFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
parseCLIPFastaData.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String
parseFastaData.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String
pipesCLIPFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
pipesFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String
removeCLIPNs 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String
removeN 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String
removeNs 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String
ShowFasta 
1 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Type/Class)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Type/Class)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Type/Class)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
showFasta 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String
translate 
1 (Function)Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy
2 (Function)Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString
3 (Function)Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy
4 (Function)Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text
5 (Function)Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String