Index
| attoCLIPFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| attoFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| chunksOf | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| Clone | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| CloneMap | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| Codon | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| codon2aa | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String |
| fastaHeader | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| fastaSeq | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| FastaSequence | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Data Constructor) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 4 (Data Constructor) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 6 (Data Constructor) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 7 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 8 (Data Constructor) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 9 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| 10 (Data Constructor) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| Germline | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| parsecCLIPFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| parsecFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| parseCLIPFasta | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| parseFasta | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| pipesCLIPFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| pipesFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| removeCLIPNs | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| removeN | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| removeNs | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Parse, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Parse, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Parse, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Parse, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Parse, Data.Fasta.String |
| ShowFasta | |
| 1 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Type/Class) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Type/Class) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Type/Class) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| showFasta | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Types, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Types, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Types, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Types, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Types, Data.Fasta.String |
| translate | |
| 1 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Lazy.Translation, Data.Fasta.ByteString.Lazy |
| 2 (Function) | Data.Fasta.ByteString.Translation, Data.Fasta.ByteString |
| 3 (Function) | Data.Fasta.Text.Lazy.Translation, Data.Fasta.Text.Lazy |
| 4 (Function) | Data.Fasta.Text.Translation, Data.Fasta.Text |
| 5 (Function) | Data.Fasta.String.Translation, Data.Fasta.String |